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      DNA提取方法的總結!
      更新時間:2019-10-25瀏覽:3176次

      DNA提取方法的一些總結:

      細菌DNA的提取:
      (一)
      試劑:
      1. 抽提緩沖液
      2% CTAB (W/V)
      2% PVP K25 (w/v) (去色素)
      100mM Tris-HCl (pH8.0)
      25mM EDTA (pH8.0)
      2.0M NaCl
      2.10M LiCl
      3. 2M LiCl
      4.DEPC-water(抑制RNA酶活性)
      5. 3M NaAc (pH5.2)
      6. 96% 乙醇
      7. 70% 乙醇
      步驟:
      1.抽提緩沖液65℃預熱;
      2. 加菌體到已經預熱的緩沖液(700ul)中混勻,65℃,10min;
      3. 加酚/LV仿/異戊醇(25:24:1),振蕩,離心12,000rpm,10min;
      4.取上清,加LV/異戊醇(24:1)振蕩,離心12,000rpm,10min;
      5. 取上清,重復4步驟;
      6. 加入1/10體積的3M醋酸鈉和1.5倍體積的乙醇(或加入等體積的異丙醇),-20C沉淀;
      11. 離心12,000rpm,10min;
      12. 棄上清,70%乙醇洗,也可以再用100%乙醇洗,然后溶解于100ml 水中。
      (二)(我們常用的方法,但是有時有些細菌特別不好提,就用上面的方法)
      1. 將菌株接種于液體LB培養基,37℃震蕩培養過夜。
      2. 取1.5ml培養物12000rpm離心2min。
      3. 沉淀物加入567 ul的TE緩沖液,反復吹打使之重新懸浮,加入30ul 10%SDS和15ul的蛋白酶K,混勻,于37℃溫育1h.
      4. 加入100ul 5mol/L NaCl, 充分混勻,再加入80ul CTAB/NaCl溶液,混勻后再65℃溫育10min。
      5. 加入等體積的酚/LV/異戊醇混勻,離心4-5min, 將上清轉入一只新管中,加入0.6-0.8倍體積的異丙醇,輕輕混合直到DNA沉淀下來,沉淀可稍加離心。
      6. 沉淀用1ml的70%乙醇洗滌后,離心棄乙醇.
      真菌DNA的提取:
      (一)
      1.取真菌菌絲0.5g, 在液氮中迅速研磨成粉
      2.加入4mL提取液,快速振蕩混勻
      3.加入等體積的4mL的LV:異戊醇(24:1),渦旋3~5min(此處是粗提沒有加酚,可以節約成本的喲!)
      4.1000rpm,4℃,5min
      5.上清用體積的LV:異戊醇(24:1)再抽提一次(10,000 rpm,4℃離心5 min)
      6.取上清,加入2/3倍體積的-20℃預冷異丙醇或2.5倍體積的無水乙醇沉淀, 混勻, 靜置約30 min
      7.用毛細玻棒挑出絮狀沉淀, 用75%乙醇反復漂洗數次, 再用無水乙醇漂洗1次, 吹干,重懸于500 ?ulTE中
      8.加入1 ul RNaseA (10 mg/mL),37℃處理1 hr
      9.用酚(pH8.0):LV仿:異戊醇(25:24:1)和LV仿:異戊醇(24:1)各抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)
      10.取上清,1/10V 3M NaAc,2.5V體積的無水乙醇, -70℃沉淀30 min以上
      11.沉淀用75%乙醇漂洗,風干, 溶于200 ulTE中,-20 ℃保存備用
      DNA提取液:0.2M Tris-HCl(pH 7.5),0.5M NaCl,0.01M EDTA,1%SDS,
      3M NaAc
      (二)
      1.真菌菌絲0.5-1 g, 在液氮中迅速研磨成粉
      2.加入3 mL 65℃預熱的DNA提取緩沖液,快速振蕩混勻65℃水浴30 min, 期間混勻2-3次
      3.加入1 mL 5M KAc,冰浴20 min
      4.等體積的LV仿:異戊醇(24:1)抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)
      5.取上清,加入2/3倍體積的-20℃預冷異丙醇, 混勻, 靜置約30 min
      6.用毛細玻棒挑出絮狀沉淀, 用75%乙醇反復漂洗數次, 再用無水乙醇漂洗1次, 吹干,重懸于500 ?L TE中
      7.加入1 ul RNaseA (10 mg/mL),37℃處理1 hr
      8.用酚(pH8.0):LV仿:異戊醇(25:24:1)和LV仿:異戊醇(24:1)各抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)
      9.取上清,1/10V 3M NaAc,2.5V體積的無水乙醇, -70℃沉淀30 min以上
      10.沉淀用75%乙醇漂洗,風干, 溶于200 ul TE中,-20 ℃保存備用。

       

      注:僅供參考!

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